堆肥設備通常系指堆肥進行生化反應的反應器裝置，是堆肥系統的主要組成部分。它的類型有立式堆肥發酵塔、臥式堆肥發酵滾筒、筒倉式堆肥發酵倉和箱式堆肥發酵池。立式堆肥發酵塔又可分為立式多層板閉和門式、立式多層漿葉刮板式、立式多層移動床式。筒倉式堆肥發酵倉可分為筒倉式靜態發酵倉和簡倉式動態發酵倉。箱式堆肥發酵池可分為矩形固定式梨翻倒發酵池、扇斗翻倒式發酵池、吊車翻倒式發酵池和臥式漿葉發酵池。